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小鼠基础知识三|实验小鼠常见名词全解析
作者:TIS 杰克森实验室
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您是否有对实验小鼠中常见的一些名词感到不解?比如野生型等位基因、突变等位基因、变异等位基因究竟有什么区别?杂合子和半合子又是指什么?如果诸如此类的问题让您困扰,请记得收藏本文。我们逐一为您解释在小鼠遗传,命名和繁育中遇到的各类名词。
1. 小鼠遗传学名词
基因:产生一条多肽链或功能RNA所需的全部核苷酸序列。基因工程小鼠就是根据实验目的,针对某个或几个特定基因进行人为的编辑而产生的。
等位基因:一对同源染色体相同位置上控制同一性状不同形态的基因。一个基因可以有多个等位基因,它们的差异可能只有一个碱基,也可能涉及一长段序列。
- 野生型等位基因:群体中某个基因最常见的等位基因。
- 突变等位基因:群体中出现频率小于1% 的等位基因。
- 变异等位基因:群体中出现频率低于野生型等位基因,但高于1%的等位基因。
基因型:是用来区分特定位点上等位基因之间关系的术语,通常包括纯合子,杂合子和半合子。
- 杂合子(Heterozygous ):一对同源染色体中,特定位点上具有两个不同的等位基因。
- 半合子(Hemizygous ): 一对同源染色体中,特定位点具有不成对的等位基因。例如:雄性 X 染色体上的等位基因,或不成对的转基因等位基因。
- 纯合子(Homozygous ): 一对同源染色体中,特定位点上具有两个相同的等位基因。
为了更好地模拟人类疾病,或者满足特定研究需求,一个小鼠品系可能携带多个基因突变,这种情况下往往在引进种群、挑选实验个体时需要考虑更多。
例如:B6.129(Cg)-Ptf1atm2(cre/ESR1)CvwKrastm4TyjPtentm1Hwu/J(Strain#:033964)为构建胰腺癌晚期恶病质常用小鼠模型。 该品系小鼠另一常用名为Ptf1aCre-ERTM;KrasLSL-G12D;Ptenflox或KPP。目前JAX在售该品系存在3个不同的基因型,他们分别是:
1) Ptf1a<tm2(cre/ESR1)Cvw>杂合子;Kras<tm4Tyj> 野生型;Pten<tm1Hwu>纯合子。
2) Ptf1a<tm2(cre/ESR1)Cvw>杂合子;Kras<tm4Tyj> 杂合子;Pten<tm1Hwu>纯合子。
3) Ptf1a<tm2(cre/ESR1)Cvw>野生型;Kras<tm4Tyj> 杂合子;Pten<tm1Hwu>纯合子。
小鼠品系定义:
Reference: The Jackson Laboratory Handbook on Genetically standardized mice